Riesgo de Introducción y/o Diseminación en México

Potato Latent Virus

Riesgo de Introducción y/o Diseminación en México

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1. INTRODUCCIÓN

El género Carlavirus está conformado por virus como PVS y PVM, pero existen otras especies descritas con una distribución más limitada como los virus PVL, PVP y PRDV reportados en Estados Unidos, Brasil y Argentina respectivamente, y que causan grandes pérdidas en sus regiones, lo cual ha provocado un gran interés en el estudio de este grupo (Rosas, 2004).

Un carlavirus con características serológicas y biológicas similares a las del carlavirus M de papa (PVM) y carlavirus S de papa (PVS) fue detectado en el cultivar de papa (Solanum tuberosum) Red La Soda por la Agencia de Ciencia Agrícola Escocesa en 1992. Durante una prueba rutinaria de microscopía electrónica de accesiones en la colección Vancouver de patatas libres de virus que crecía en la prueba de invierno de California en 1993, se encontró un virus filamentoso en forma de barra similar a PVS y PVM en una red La Soda clon de Nebraska. El virus fue aislado y purificado. Se desarrolló el anticuerpo monoclonal, MAb 4E12, que es altamente específico para el virus PotLV. Desde 1994 a 1998, las accesiones en la Colección de Vancouver de Patatas Libres de Virus se analizaron mediante el Ensayo Inmunoabsorbente Ligado a Enzimas de Triple Anticuerpo (TAS-ELISA) usando el MAb 4E12. Siete accesiones probadas de 1994 a 1996 fueron infectadas con PotLV. Ninguna de las 270 y 267 muestras de esta colección dio positivo para este virus en 1997 y 1998, respectivamente. En 1997 y 1998, las 137 accesiones en la colección nacional de Varietal de los EE. UU. Mantenidas en Presque Isle, Maine, también se analizaron usando el MAb 4E12. Los cultivares High Plains, Platte y Red La Soda fueron las únicas muestras positivas para PotLV. Nicotiana benthamiana, N. megalosiphon y N. occidentalis son nuevos huéspedes sistémicos para PotLV. El ensayo de TAS-ELISA con el MAb 4E12 ahora es parte de la prueba estandarizada para PotLV en Canadá.

Este virus fue denominado al principio como una especie tentativa, aunque se sabía muy poco de sus propiedades biológicas llamándolo Red La Soda Virus (Brattey et al., 1995). Sin embargo, tiempo después se reconoció como una especie definitiva del género Carlavirus por el estudio serológico y sobre todo por el secuenciamiento parcial del genoma viral (Brattey et al., 2002).

Se necesitan más datos de este virus, así como de otros nuevos Carlavirus, en su posible impacto en la cosecha y la distribución geográfica. Se desconocen los posibles riesgos que puede causar este virus en la papa, ya que aún faltan más estudios y hay poca evidencia de los posibles daños que pueda causar al cultivo y a los tubérculos (SAGARPA, 2012).

1. DESCRIPCIÓN DEL VIRUS

Acrónimo: RLSV, PLV, PotLV

Sinónimo: Potato Red La Soda Virus, Potato Latent Carlavirus

Código decimal ICTV: 2015.011Wp

Código EPPO: POTLV0

Ubicación taxonómica. La información que a continuación se presenta, forma parte del 9º reporte publicado por el Comité Internacional sobre Taxonomía de Virus (ICTV, 2018).

Orden: Tymovirales

Familia: Betaflexiviridae

Subfamilia: Quinvirinae

Género: Carlavirus

Especie: Potato latent virus

Morfología de la partícula. Los viriones son filamentos y ligeramente flexibles, con 610-700 nm de longitud y 12-15 nm de diámetro. Tienen simetría helicoidal con un peso de aproximadamente 3.4 nm (ICTV, 2018).

Propiedades de la partícula

1. Punto de inactivación térmica: Para el género Carlavirus, el punto de inactivación térmica del virión en Nicotiana glutinosa es de 65-70º C (ICTV Management, 2008).
2. Longevidad in vitro: Es más de 90 días (ICTV Management, 2008).
3. Punto final de dilución: El exponente decimal del punto final de dilución generalmente es de 5-6 (ICTV Management, 2008).
4. Densidad de flotación: En soluciones de cloruro de cesio (CsCl) es de 1.3 g cm-3 (ICTV, 2018).
5. Ácido nucléico: Los viriones contienen una única molécula de ARN monocatenario de sentido positivo (ssRNA) que tiene un rango de tamaño de 7,4-7,7 kb cuando se estima mediante análisis de gel de agarosa, aunque el análisis de secuencia de longitud completa sugiere que los tamaños del genoma están en el intervalo de 8,3-8,7 kb (ICTV, 2018). El genoma del PLV es aproximadamente 500-600 nucleótidos más corto que otros Carlavirus que infectan papa (Nie, 2008).

Propiedades de la secuencia. Al igual que en otros Carlavirus, se identificaron seis marcos de lectura abiertos (ORFs) en el genoma de PLV. El tamaño de ORF 1, que codifica una replicasa de 203 kDa de 1.780 aminoácidos, es de 5.343 nucleótidos de longitud; los ORFs 2-4 consisten en 690, 321 y 198 nucleótidos respectivamente, que codifican la proteína 1 del bloque del gen triple (TGB) de 229 aminoácidos, TGBp2 de 106 aminoácidos y TGBp3 de 65 aminoácidos correspondientemente; el ORF 5 está compuesto por 873 nucleótidos y codifica la proteína de la cubierta (CP) de 290 aminoácidos; el ORF 6 consta de 300 nucleótidos que codifica la proteína de unión al RNA (RBP) de 99 aminoácidos. Las regiones 5´ y 3´ no traducidas (UTR) tienen 74 y 76 nucleótidos de longitud, respectivamente (Nie, 2008).

El análisis BLAST de la secuencia genómica completa de PLV reveló que la secuencia entre 4.000-5.400 nucleótidos, que codifica la polimerasa de RNA dependiente de RNA (RdRp de ~1300 aminoácidos), está altamente conservada, con una identidad de aproximadamente 70% en los Carlavirus. Otro segmento (~6.850-7.450 nucleótidos), que codifica la mayor parte de la proteína de la cubierta (~64-262 aminoácidos), también se encontró conservada, con una identidad alrededor del 66%. El análisis filogenético a nivel de la secuencia del genoma completo mostró que PLV formó un grupo con phlox virus B, chrysanthemum virus B, phlox virus S, daphne virus S, hippeastrum latent virus, hop mosaic virus, hop latent virus, aconitum latent virus, narcissus common latent virus y PVM (Nie, 2008).

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