TBP es un factor universal

TBP es 1 factor universal

Conceptos clave

• TBP es 1 componente del factor de posicionamiento que es requerido para que cada tipo de ARN polimerasa se 1 a su promotor.
• El factor de la ARN polimerasa II esTF11D, el cual consiste en de TBP y ~14 TAFs, con 1 masa total de ~800 kD.
• TBP se une a la caja TATA en el surco menor del ADN.
• TBP forma 1 montura alrededor del ADN y se enrolla el por ~80°.

Antes que la iniciación de la transcripción pueda comenzar, la cromatina debe ser modificada y remodelada a la configuración abierta, y cualquier nucleosoma posicionado sobre el promotor debe ser movido por eliminado en todos los casos de los promotores eucariotas (examinamos este aspecto del control de la transcripción más estrechamente en el capítulo titulado Regulación de la transcripción eucariótica). En el punto de inicio es posible para 1 factor de posicionamiento unirse al promotor. Cada clase de ARN polimerasa es asistido por 1 factor de posicionamiento que contiene TBP asociado con otros componentes. El nombre TBP significa “proteína de unión TATA”; esta fue inicialmente llamada así debido a que fue 1 proteína que unida a la caja TATA en los genes de la ARN polimerasa II. Y fue subsecuentemente descubierta por también ser parte de los factores de posicionamiento SLI para la ARN polimerasa I (ver la sección anterior en este capítulo titulada La ARN polimerasa I tiene 1 promotor bipartita) y el TFIIIB ARN de la polimerasa III (ver la sección titulada La polimerasa de ARN III usa promotores río arriba y río abajo). Para esas 2 ARN polimerasas posteriores, TBP no reconoce la secuencia de la caja TATA (excepto en los promotores tipo 3 de los promotores pol III); así, el nombre es inapropiado. Además, muchos promotores de la ARN polimerasa II carecen de cajas TATA, pero requieren aún la presencia de TBP.

Para la ARN polimerasa II, el factor de posicionamiento es TFIID, el cual consiste de TBP asociado con hasta otras 14 subunidades llamadas TAFs (por factores asociados a TBP). Algunos TAFs son esteiquimétricos con TBP; otros están presentes en menores cantidades, lo cual significa que hay múltiples variantes de TFIID. Los TFIIDs que contienen diferentes estados podrían reconocer promotores con combinaciones diferentes de elementos conservados descritos en la sección previa titulada El punto de inicio de la ARN polimerasa II. Algunos TAFs son específicos del tejido. La masa total de TFIID típicamente es ~800kD. Los TAFs en TFIID fueron originalmente denominado en la forma TAFII00, por ejemplo, donde el número “00” a la masa molecular de la subunidad. Recientemente los TAFs de la ARN polimerasa II han sido renombrados TAF1, TAF2, y también anterior; en esta nomenclaturaTAF1 es el mayor TAF, TAF2 es el siguiente más grande, y los TAFs homólogos en otras especies también tienen los mismos nombres.

La figura 20.8 muestra que el factor de posicionamiento reconoce al promotor de diferente manera en cada caso. En los promotores para la ARN polimerasa III, el TFIIIB se une adyacente TFIIIC. En los promotores para la ARN polimerasa II, SL1 se une junto con UBF. TFIID es solamente el responsable de reconocer los promotores de la ARN polimerasa II. En 1 promotor que tiene 1 elemento TATA, TBP se une específicamente a la cajaA TATA, pero en los promotores sin TATA, los TAFs tienen el papel de reconocer otros elementos promotores, incluyendo el Inr y a DPE. Sin importar lo que esto signifique al entrar al complejo de iniciación, éste tiene el propósito común de la interacción con la ARN polimerasa.

TBP tiene la propiedad inusual de unirse al ADN en el surco menor. (La vasta mayoría de las proteínas que se unen a ADN se unen en el surco mayor). La estructura cristalina de TBP sugiere 1 modelo detallado para su unión al ADN. La figura 20.9 muestra que ésta rodea 1 cara del ADN, formando 1 “montura” alrededor del surco menor, la cual se ajusta a esta montura. En efecto, la superficie interior de TBP se une al ADN, y la superficie exterior mayor está disponible para el contacto extenso con otras proteínas. El sitio de unión al ADN consiste de 1 dominio C-terminal que está conservado entre las especies, en el extremo variable A e N-terminal está expuesto para interactuar con otras proteínas. Esta es 1 medida de la conservación del mecanismo en la iniciación transcripcional de la secuencia de unión al ADN de TBP está 80% conservada entre las levaduras y los humanos.

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