TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR III

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TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR III

Docente: Elizabeth Ortiz Gutiérrez eortiz@correo.cua.uam.mx

Alumna: Miriam J. De la Rosa Esquivel miriamdelarosa.bm@gmail.com

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¿Qué es ΔΔCT?

ΔΔCT es un método para analizar datos experimentales de una qPCR (PCR cuantitativa) para determinar la expresión génica, haciendo uso de un gen de referencia en uno de los dos casos, este método es llamado así ya que se divide en dos procesos, el  primer ΔCT es la diferencia en el ciclo umbral (ciclo en el que el nivel de fluorescencia alcanza una cierta cantidad) entre el objetivo y los genes de referencia, por lo tanto ΔΔCT es la diferencia en ΔCT y las muestras de referencia.

¿Para qué se usa  ΔΔCT?

La qPCR o PCR cuantitativa es usada para cuantificar los niveles de expresión génica, bajo dos marcos de referencia el cálculo absoluto  y relativo

-Absoluta: Establece el número de copias que se encuentran según sea la señal de la PCR, para ello hace uso de una curva estándar, este método de cuantificación es complejo y cotoso, por lo cual su uso es mínimo.

-Relativa: Determina los cambios en la expresión del gen no requiere estándares con concentraciones determinadas, en ella se busca obtener el volumen de cambios fisiológicos en los niveles de expresión genética, esto lo hace de forma comparativa a genes de referencia.

2- ΔΔCT

En la búsqueda por corregir los errores de la ΔΔCT se ha diseñado un nuevo método de análisis llamado 2- ΔΔCT que manifiesta la proporción  obtenida de la relación entre los valores CT de la muestra y los valores CT del control.

Referencias

1. Kenneth J. Livak and Thomas D. Schmittgen, (2001), Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and the 22DDCT Method, recuperado de http://www.idealibrary.com 
2. Xiayu Rao, Xuelin Huang,  Zhicheng Zhou and Xin Lin, (2014), An improvement of the 2ˆ(–delta delta CT) method for quantitative real-time polymerase chain reaction data analysis, recuperado de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4280562
3. Livak KJ1, Schmittgen TD, (2001), Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method, recuperado de https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11846609

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