Bioinformática y Programación

Bioinformática y Programación

Para cada uno de los siguientes accesion number:

D12591

U49742

• En Genbank:

• Identificar el nombre del gen. L-lactate dehydrogenase y Human rhodopsin gene.
• La longitud en pares de bases del gen. 1364 bp y 6953 bp.
• El organismo del cual se obtuvo el gen. Lactobacillus casei subsp. Casei y Homo Sapiens.
• Indique si es DNA genómico o extragenómico.  Ambos son genómicos. 
• ¿Cuál de ellos contiene exones y cuantos exones? U49742 contiene 5 exones.
• ¿Por qué el otro gen no contiene exones? Porque D12591 es una secuencia perteneciente a los procariotas entonces toda su secuencia está formada por exones, a diferencia de U49742 que marca claramente las partes de la secuencia que codifican.

• En Uniprot:

• Indicar el accesion number que da Uniprot. P00343 y P08100
• Identificar en que parte de la célula se encuentra la proteína. Membrana
• En el apartado de Pathol/Biotech; indicar si está relacionada a una enfermedad. U49742 está involucrada en la Retinitis Pigmentosa 4 (RP4).

• Indique las modificaciones postraducción que ocurren.  

D12591: 

[pic 1]

            U49742:        

[pic 2]

• La longitud de la proteína.  348 
• La masa molecular de la proteína. 38,893 Da

En PubMed, realice una búsqueda de literatura científica de algún tema que le sea de interés (cualquiera) y escoga tres artículos o review. Léalos y con sus palabras explique cuál es el la información que haya captado de los textos que leyó. Ponga las fuentes utilizadas en formato APA. No es necesario que entienda al 100% la información, solo la idea principal. Algunas opciones de temas a buscar:

• Vacunas comestibles.
• Biorremediación de suelos y agua.
• Producción de anticuerpos.
• Células madre.
• CRISPR-CAS9.
• Cultivos genéticamente modificados.

Una cuartilla por cada texto leído

Ratones son inducidos con Diabetes por medio de CRISPR/Cas9

En este artículo se habla sobre ratones a los que les fueron modificados sus receptores de leptina por medio de la microinyección de CRISPR/Cas9. Esto con el objetivo de comprender más a fondo la diabetes de tipo 2 en humanos y los resultados obtenidos en este estudio puedan ser usados para el futuro estudio e investigación de la obesidad y diabetes en nuestra especie.

La obesidad es uno de los problemas que enfrentamos día a día como sociedad. Esta enfermedad ha sumado una larga tasa de mortalidad en las últimas décadas y la cifra sigue subiendo. Por lo tanto, la identificación de nuevos tratamientos o formas de prevenirlo son necesarias.

Debido a la prohibición de modificaciones genéticas experimentales en humanos, los individuos usados como objeto de estudio son animales. Se busca que los animales usados en experimentos tengan sistemas o cuerpos parecidos a los de los humanos para así poder interpretar los resultados de la experimentación de una manera más precisa y acertada. “Hay cinco loci relacionados con la obesidad en modelos de ratón de enfermedad metabólica, de estos 5 ob y db son los más estudiados (obesidad y diabetes). Los genes de estos loci fueron identificados como leptina (lep) y el receptor de leptina (lepr) en 1993 y 1994, respectivamente.” (1)

Como se mencionó antes, en este estudio se usó el sistema de CRISPR/Cas9 para modificar los receptores de leptina en los ratones, en el estudio se explica como un “knockout” (¿eliminación de éstos?) que lleva a los ratones a expresar un fenotipo de diabetes y obesidad extrema. El CRISPR-Cas9 fueron microinyectados en los embriones C57BL/6J y las mutaciones que éstos tuvieron fueron confirmadas mediante el mètodo de Sanger, al finalizar el experimento fueron eutanasiados. [pic 3]

1. Roh, J. I., Lee, J., Park, S. U., Kang, Y. S., Lee, J., Oh, A. R., Choi, D. J., Cha, J. Y., & Lee, H. W. (2018). CRISPR-Cas9-mediated generation of obese and diabetic mouse models. Experimental animals, 67(2), 229–237. https://doi.org/10.1538/expanim.17-0123

Grupo inicial de infectados con Coronavirus en Wuhan, China es consistente con la transmisión de humano a humano

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