Tiburones Rojos de Veracruz en el Torneo Clausura

El torneo Clausura 2003 comienza con un cuadro con jugadores de experiencia como Martín Rodríguez, Isaac Terrazas, Andy Pérez, Diego Cocca, Damián Grosso y Luis Hernández. El Veracruz llega hasta las semifinales donde caen derrotados ante Morelia, bajo la dirección técnica de Daniel Guzmán Castañeda.

Suma 27 puntos en el Apertura 2003 y se queda a uno solo de alcanzar el repechaje, pero en el clausura 2004 ocupa el último lugar general. En el Apertura 2004 llegan al equipo Cuauhtémoc Blanco, Braulio Luna, Pablo Quatrocchi, Walter Jiménez, Christian Giménez y Kléber Boas. El gobierno del estado se comprometió en la remodelación del estadio, y con esta inversión el equipo terminó como líder del torneo, pero cayó en los cuartos de final de la liguilla ante los Pumas de la UNAM.

En el Clausura 2005 salió del equipo la figura del torneo anterior (Cuauhtémoc Blanco) pero se mantendría a la base del equipo, a pesar de esto los Tiburones terminaron siendo el penúltimo lugar en la tabla general.

Tras varias disputas que aún no acaban, los Tiburones Rojos de Veracruz pasaron a manos del gobierno del estado. Los torneos después de este movimiento han sido malos para el club pues no destacó en ninguno de ellos, tal vez lo más rescatable es la salvación del descenso en el último partido del torneo clausura 2006, ya que con el tanto de Lucas Ayala el equipo logró el empate 1:1 ante Morelia, resultado con el cual el club libró el descenso a la Primera 'A'.

Para el torneo Apertura 2006 el equipo tuvo una importante renovación de plantel, contratando a jugadores de renombre como los colombianos Martín Arzuaga y Tressor Moreno, lamentablemente ninguno de los dos fichajes dieron los resultados deseados, el primero por un problema físico que le impidió mostrar sus cualidades, y el segundo por actos de indisciplina, situaciones que los llevaron a salir del equipo. Finalmente el equipo clasificó al repechaje en donde perdió con las Chivas. En el torneo Apertura 2007, empezaron siendo dirigidos por el técnico argentino Nery Alberto Pumpido, sin embargo fue destituido tras la mala campaña que realizó al frente del equipo, siendo sustituido por el también entrenador argentino Antonio Mohamed, pero la amenaza del descenso continuó debido a los malos resultados que se siguieron cosechando.

Al término del Apertura 2007, el equipo terminó en la penúltima posición de la tabla por el no descenso con un porcentaje de 1.0706, sólo por arriba de los Camoteros del Puebla y por debajo de los Tigres de la UANL.

En el torneo de Clausura 2008, con tan sólo dos fechas transcurridas y debido a los malos resultados, el entrenador argentino Antonio Mohamed fue destituido, siendo sustituido por Miguel Herrera.

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