Actividad # 8: Metagenómica de secuencias vs metagenómica funcional

Metagenómica de secuencias

Metagenómica funcional

Es de suma importancia para identificar genes y rutas metabólicas.

La búsqueda funcional permite seleccionar enzimas en base a su actividad.

Engloba el análisis de secuencias de Ácidos Nucleicos de muestras obtenidas del medio ambiente.

Determinar cuáles genes participan en una ruta de interés.

Se puede utilizar para ensamblar genomas, completar rutas metabólicas, comparar organismos de comunidades distintas.

Establecer modelos predictivos que sirvan para entender la función de las comunidades microbianas.

Se puede establecer un grado de diversidad y un número de especies presentes en la muestra del medio ambiente.

Permite designar funciones a proteínas hipotéticas.

Debido a la gran cantidad de técnicas de secuenciación, es fácil y rápido obtener las secuencias obtenidas, además de un rango mínimo de error.

Puede obtener genes completos, sin necesidad de una base de datos.

Al ser necesaria una secuencia no se garantiza la obtención del genoma completo, de genes de interés u otra clase de secuencias.

Asegura una forma completa de un gen o de varios genes requeridos para casos en específico.

Es posible encontrar una gran diversidad de microorganismos que no es posible bajo técnicas de cultivo tradicionales.

Es posible conocer la función específica de un microorganismo en el medio ambiente, aunque este no se pueda cultivar e investigar en el laboratorio.

Es muy complicado traducir la secuencia de un filo microbiano en una posible función específica en el medio ambiente.

Es necesario obtener patrones de expresión de las moléculas con funciones tentativas para llevar a cabo el análisis,