Bioinformática con aplicación al de Biorremedación

Universidad Inter-Americana de Puerto Rico

Título: Bioinformática con aplicación al de Biorremedación

Nombre de los autores:

José Luis Batista

Cristopher De Los Santos

Yoshua Ortiz

Ricardo Márquez

Introducción:

Alcaligenes es una bacteria la cual pertenece al género de bacterias aerobicas , pertenece al género de bacterias no fermentadoras. Algunas bacterias de este género pueden llevar a cabo una respiración anaeróbica,  únicamente si están en presencia de nitrato o nitrito. Las cepas de alcaligenes podemos encontrarlas en el tracto intestinal de los vertebrados ,materiales en descomposición , agua y suelo. La alcaligenes también es la causante de infecciones de orina en pacientes encamados.

Llevamos a cabo la selección de este organismo debido a que aparece como un buen biorremediador en varios artículos científicos. Además hicimos referencia a una investigación de Biorremediación de lodos petroquímicos mediante el uso de la biota microbiana autóctona en un oxisol del municipio Lagunillas del estado Zulia, Venezuela. En la cual confirma nuestro organismo como un buen biorremediador.

Pasos para lograr hallar la secuencia del organismo.

• Acceder a la página web www.ncbi.com
• Escogemos la categoría de nucleótido.
• Buscamos el organismo por ‘16s rrna alcaligenes, genoma no completo
• Oprimimos fasta.
• Aparece la secuencia de nuestro organismo

Nombre de la bacteria : Alcaligenes sp

Secuencia de la bacteria: Alcaligenes sp. RH-28 gene for 16S rRNA, partial sequence

 CTCAGATTGAACGCTAGCGGGATGCTTTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCGCGAGAGAGCTTGCTCTCT

TGGCGGCGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATATATCGGAACGTGCCCAGTAGCGGGGGATAACTACTCGAAA

GAGTGGCTAATACCGCATACGCCCTACGGGGGAAAGGGGGGGATCGCAAGACCTCTCACTATTGGAGCGG

CCGATATCGGATTAGCTAGTTGGTGGGGTAAAGGCTCACCAAGGCAACGATCCGTAGCTGGTTTGAGAGG

ACGACCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTGGAC

AATGGGGGAAACCCTGATCCAGCCATCCCGCGTGTATGATGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAGTACTTTTGG

CAGAGAAGAAAAGGTATCCCCTAATACGGGATACTGCTGACGGTATCTGCAGAATAAGCACCGGCTAACT

ACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGTGTGT

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CCGAGCTAGAGTATGTCAGAAGGGGGGTAGAATTCCACGTGTAGCAGTGAAATGCGTAGATATGTGGAGG

AATACCGATGGCGAAGGCAGCCCCCTGGGATAATACTGACGCTCAGACACGAAAGCGTGGGGAGCAAACA

GGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCCTAAACGATGTCAACTAGCTGTTGGGGCCGTTAGGCCTTAGTA

GCGCAGCTAACGCGTGAAGTTGACCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACG

GGGACCCGCACAAGCGGTGGATGATGTGGATTAATTCGATGCAACGCGAAAAACCTTACCTACCCTTGAC

ATGTCTGGAAAGCCGAAGAGATTTGGCCGTGCTCGCAAGAGAACCGGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTC

GTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTCATTAGTTGCTACGC

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