ESCUELA DE CIENCIAS AGRÍCOLAS, PECUARIAS Y DEL MEDIO AMBIENTE (ECAPMA)

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The application of molecular data to the phylogenetic delimitation of species in bryophytes: A note of caution

La aplicación de los datos moleculares para la delimitación filogenético de las especies en briofitas : Una nota de precaución

ALAIN VANDERPOORTEN

 & A. JONATHAN SHAW

• Demostrar por medio del estudio y comparaciones de datos moleculares la aparición de nuevas especies, identificando cambio de características a través de la evolución biológica por medio de la asociación entre identidades de secuencia y de especies, así como la aplicación de conceptos filogenéticos y las diferencias en la evolución morfológica y molecular, en las especies de briofitas.

• Usar datos moleculares para la clasificación de las especies de la división briofita que son plantas verdes    de importancia para la ciencia en cuanto a historia evolutiva en vegetales, tradicionalmente se les divide en tres categorías, Antocerotes, Hepáticas y Musgos.  La clasificación taxonómica de las briófitas, basada en caracteres morfológicos en muchos casos carece de diferenciación y así mismo de validez al no ser tan precisa comparada con la filogenia molecular.

• Por los avances en las técnicas moleculares y la capacidad de generar secuencias de ADN, las  filogenias basadas en análisis de múltiples genes se han vuelto cada vez más utilizables, permitiendo probar especies mediante la aplicación de conceptos de especie filogenética, el principal el criterio de conceptos de especie filogenética es monofilia. A partir de estas investigaciones  se pueden construir  las historias evolutivas de los linajes, aclarar los conceptos de ausencia o presencia de monofilia para los grupos taxonómicos, así como sus relaciones de parentesco. Pero también hay que tenerse en cuenta que un grupo que contiene algunos pero no todos los descendientes del ancestro común más reciente o las filogenias resueltas mal se llama parafilético.

• Es de suponer que las tasas de evolución morfológica y molecular deben estar relacionadas, siendo de este modo especies compatibles, pero cuando no es así son desacoplados y la heterogeneidad en este caso de briofitas se evidencia por las medidas reales de las tasas de transición morfológica en el tiempo.

Este tipo de estudios evidenciara el futuro mayor información acerca de los mecanismos moleculares de la morfogénesis en musgos, así se tendrán las herramientas necesarias para descubrir cómo estas morfologías extrañas han evolucionado y encontrar los genes que subyacen a los rasgos de importancia ecológica, con los avances de la genómica poblacional y genética cuantitativa,

Futuros estudios puede encontrar relaciones de los árboles  genealógicos actuales  con   los ancestros de musgos o genes, en particular los árboles de frutos comestibles sabiendo que los vegetales evolucionaron de las briofitas, que aún  pueden seguir evolucionando y presentar adaptaciones a nuevos ambientes, en aspectos como el papel que cumplen en  la regulación hídrica para que sea de mayor aprovechamiento en la ciencia,  como por ejemplo, genes que se han mantenido en  evolución,  en la producción de frutos dulces y que se encuentran en algunas partes de las esporas  de los musgos.

Con la ayuda de la tecnología que sigue avanzando cada vez más, se recomienda continuar con la investigación de especies de briofitas, ya que aún falta mucho estudio por establecer de forma concisa la delimitación y su diferenciación.

•        Uso de técnicas moleculares en el estudio de briófitas como modelos de procesos evolutivos vegetales

•        Secuenciación de ADN de especies vegetales briófitas para establecer relaciones filogenéticas

•        Uso de técnicas moleculares en estudios taxonómicos de especies de briófitos

Discord between morphological and phylogenetic species boundaries: incomplete lineage sorting and recombination results in fuzzy species boundaries in an asexual fungal pathogen

La discordia entre los límites morfológicos y filogenéticos de especies : linaje incompleta clasificación y resultados de recombinación en límites de las especies difusas en un hongo patógeno asexual

Jane E Stewart, Lavern W Timmer

, Christopher B Lawrence, Barry M Pryor and Tobin L Peever

Estimar cuantitativamente el número de especies de Alternaria  que causa en los arboles cítricos mancha marrón a nivel mundial, clasificando la transmisión de la enfermedad de forma asexual y filogénica a través del tiempo y su evolución en los territorios, utilizando métodos desarrollados recientemente    al parecer se encuentran hongos morfológicamente  indistinguibles, pero  con métodos  moleculares  podemos  ver la historia evolutiva.

El estudio se hizo por medio de la  toma de muestras a nivel mundial de A. alternata  patotipo mandarina  con el  fin de establecer los linajes filogenéticos  mediante concatenación de genes  teniendo en cuenta la monófila y a partir de la historia evolutiva y recombinación de  linaje conocido genéticamente en  distintos cítricos para el establecimiento de límites de estas especies.

Para la  clasificación  de las especies, Alternaria es   hongo que  es muy indistinguible y causa daños a nivel mundial en la agricultura, específicamente en cítricos, teniendo dificultades en la clasificación ya que tiene una morfología  muy cambiante,   se basa en conidios grandes o pequeños,  gracias a que es muy cambiante  se cae en errores, el hogo se adapta a condiciones ambientales y se camufla muy bien en  la formación de melanina o causa de las manchas marrón en plantas, frutos y hojas.  

El interés de la identificación de estas enfermedades infecciosas es a nivel mundial ya que se trasmite por medio de las exportaciones e importaciones de los frutos o plantas y por medio de estudios se han identificado los linajes filogenéticos en el mundo, de 13 haplotipos A. alternata clasificados es 3 linajes y por medio del análisis de coalescencia para la su delimitación de las especies y su patogenicidad.

Aún quedan muchas investigaciones por hacer para determinar la limitación del movimiento de los cítricos entre países y por medio de métodos moleculares se pueden comparar los patovariedades y llegar a ver sus relaciones filogenéticas.

• Estudio molecular de genes responsables en la producción de melanina y la resistencia al ambiente de Alternaria ssp.
• Análisis molecular de los mecanismos de resistencia de especies cítricas colombianas frente a la colonización por Alternaria.
• Técnicas moleculares para determinar la variabilidad genética de Alternaria alternata.

Integrating coalescent and phylogenetic approaches to delimit species in the lichen photobiont Trebouxia

La integración de enfoques coalescentes y filogenéticos para delimitar las especies en el fotobionte de líquenes Trebouxia

Anna D. Sadowska-Des´ , Francesco Dal Grande , H. Thorsten Lumbsch , Andreas Beck,Jürgen Otte, Jae-Seoun Hur, Jung A. Kim  Imke Schmitt

El estudio es basado en la coalescencia (ancestro común más reciente) y las relaciones filogenéticas para evaluar límites de las especies en la formación de líquenes entre Trebouxia y  Lasallia pustulata  sistemas simbióticos es los que se evidencia la necesidad de conocer sus límites de especie como un requisito previo para el estudio de la especiación, coevolución y la selectividad a través del tiempo.

Frente a la importancia que tiene este estudio evolutivo para hacer análisis del comportamiento biológico de los organismos, se debe conocer la relación entre especies para lograr la relación simbiótica que se ha mantenido a lo largo del tiempo, entre hongo- alga y las mplicaciones a nivel de desarrollo evolutivo entre los dos organismos, sus características, sus adaptaciones al medio, a la selectividad geográfica, lo cual se evidencia a través de las pruebas moleculares usadas para tal fin (PCR) y su secuenciación molecular, el estudio filogenético y la coalescencia son factores importantes para hacer una comparación del desarrollo evolutivo de las especies "putativas" que se asocian, delimitando especies dentro del género heterogéneo.

El estudio evolutivo de los organismos a través de las diferentes técnicas moleculares permite para hacer un análisis del comportamiento biológico de diferentes especies de organismos que amplían el conocimiento de sus diferentes características morfológicas, anatómicas , factores de adaptación, patrones de interacción entre las especies, factores geográficos así como estudios genéticos que permiten establecer relaciones filogenéticas y ancestrales entre organismos. Las aproximaciones recientes permiten hallar evidencia que respalda el proceso de evolución, el trabo de la filogenia y los mecanismos bioquímicos de los organismos.

• Técnicas moleculares que permiten reconocer secuencias génicas y establecer procesos de desarrollo evolutivo entre organismos que establecen relaciones biológicas.
• Estudios moleculares que permiten establecer las relaciones filogenéticas de la asociación simbiótica de Tribouxia y Lasallia pustulata.

• •        Estudios moleculares para el estudio de la identificación y evolución de líquenes.