Ejercicio ruta metabólica. Presentación de proyecto de obtención de capsorubina

[pic 1][pic 2]

Universidad Autónoma de Nuevo León

Facultad de Ciencias Biológicas

Técnicas Genómicas y Proteómicas

Ejercicio ruta metabólica. Presentación de proyecto de obtención de capsorubina.

Nombre: Martínez Sánchez Claudia Guadalupe.

Matricula: 1874492.

Grupo: 182.

8° semestre.

Carrera Biólogo.

Dra. Ana Laura Lara Rivera.                                                    

                                  San Nicolás de los Garza, a 16 de noviembre de 2022. 

Para la obtención de los datos, hacemos uso de la colección de bases de datos en línea de genomas, rutas enzimáticas, y químicos biológicos “KEGG”, ingresando a esta, se puede observar una gran variedad de opciones y herramientas. Damos click al apartado “KEGG PATHWAY”.

[pic 3][pic 4]

En organismo, incorporamos el nombre del organismo de estudio, la especie Capsicum annuum, y dar click el “Select”.

[pic 5][pic 6]

En Enter keywords se ingresa el nombre del pigmento derivado de la síntesis de carotenoides “capsorubina” y damos click en “Go”.

[pic 7]

Aparecerá un cuadro con la información, abrir la imagen de “Carotenoid biosynthesis”.

[pic 8][pic 9]

[pic 10]

La capsorubina (capsorubin) es un pigmento derivado de la síntesis de carotenoides, tiene una coloración rojiza que se utiliza en la industria de alimentos como colorante de quesos y dulces entre otros. Busque este compuesto en la base de datos KEGG para el chile (Capsicum annuum) y conteste lo siguiente:

1. ¿Cuál es el sustrato principal a partir del cual se sintetiza la capsorubina?

Violazantina.

[pic 11][pic 12]

1. ¿Cuáles son las enzimas que intervienen en la síntesis de la capsorubina?

Capsantina/capsorubina sintasa 5.3.99.8, zeaxantina epoxidase 1.14.15.21, 15-cis-phytoene desaturase 1.3.5.5, zeta-carotene desaturase 1.3.5.6.

[pic 13][pic 14][pic 15][pic 16][pic 17][pic 18]

1. ¿Qué otros compuestos se forman a partir del compuesto intermediario que genera capsorubina en esta ruta metabólica?

Violaxantina, neoxantina, xantoxina, ácido xantóxico, etc.

[pic 19][pic 20][pic 21][pic 22][pic 23]

1. ¿A qué genes se les podría hacer knockout/knockdown para evitar esto? Evitar que la violaxantina se convierta en algo distinto a la capsorubina.

A los genes de violaxanthin de-epoxidase (1.23.5.1) y 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase NCED2 (1.13.11.51).

[pic 24][pic 25][pic 26]

Este colorante se produce en una planta. Supongamos que se desea producir capsorubina. Para no tener que esperar no tener que esperar a los tiempos de cosecha si se sembrara la planta, un cultivo de algas podría ser una alternativa. Busque la misma ruta metabólica para Chlorella variabilis 

...