Supuesta Capacidad Metabólica De Bacterias Que Expresan LinA Y LinB Principales Enzimas Involucrados En La Degradación De Hexaclorociclohexano (HCH)

Hexaclorociclohexano (HCH) es un agente químico comúnmente, encontrado en insecticidas, fungicidas, y plaguicidas. Este es compuesto altamente persistente en el medio ambiente que causa graves problemas de salud en el hombre, en la vida silvestre, en suelos y aguas. Aunque su uso fue prohibido en varios países, aún se encuentra en una amplia variedad de productos controladores de plagas distribuidos por todo el mundo. Se escogió la Sphingobium paucimobilis UT26 como modelo, ya que, albergan el paquete completo de genes lin, relacionados con el metabolismo de HCH. S. paucimobilis, al igual que otras bacterias capaces de degradar hexaclorociclohexano, utiliza dos enzimas principales en los primeros pasos de deshalogenación del compuesto, a saber hexaclorociclohexano dehidroclorinasa (LinA/linA) y haloalcano deshalogenasa (LinB/linB). Del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), se obtuvo las secuencias completas de las principales proteínas relacionadas con la degradación de HCH y fueron comparadas con BLAST y alineadas en CLUSTALW2., mostrando un alto grado de homología entre las enzimas del organismo modelo y las encontradas en Xanthomonas ICH12, haciendo suponer que esta bacteria eventualmente podría tener la capacidad para metabolizar el compuesto; A continuación se observó la relación filogenética entre el organismo modelo y X. ICH12 y se construyó un árbol filogenético con las secuencias de las proteínas alineadas en MEGA6. Finalmente se ubicó en las proteinas cristalizadas de LinA y LinB los sitios activos usando el visualizador molecular PyMol.

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