TÓPICOS SELECTOS DE BIOTECNOLOGÍA I

INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE[pic 1][pic 2]

BIOTECNOLOGÍA

DEPARTAMENTO DE BIOPROCESOS ACADEMIA DE BIOTECNOLOGÍA

TÓPICOS SELECTOS DE BIOTECNOLOGÍA I

SEMESTRE 2022/2        ENERO-JUNIO 2022        GRUPO 6BV3

TAREA:

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BIOLOGÍA SINTÉTICA

EQUIPO 7:

Franco Flores Karla Ximena Guerra Pacheco Arandi Joaquín Vargas Monica Itzel Ortega Alonso Juan de Dios

PROFESORES:

Noé Valentín Durán Figueroa Marcos Iván González Jaime

Lunes 06 de Junio del 2022

ARTÍCULO 1[pic 4]

Endoribonuclease-Based Two-Component Repressor Systems for Tight Gene Expression Control in Plants.

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Figura 1. Circuito presentado en el Artículo 1.

De la Figura 1, identificar y desglosar:

1. Todas las composable parts del sistema con una breve descripción de su función.

Elemento sensitivo transductor:

Promotor 1 (Pro1). Encargado de la expresión de la proteína Csy4 y el gen NLS (gen de localización nuclear).[pic 6]

Promotor 2 (Pro2). Encargado de la expresión del Target Gene y su gen cog (DFP/RFP).

1. Las entradas y salidas del sistema.

Input: Estímulos ambientales, metabólicos o químicos. En un experimento se usó dexametasona para el promotor de Csy4.

Output: Como salida se busca la regulación de expresión génica de dos componentes para controlar la síntesis de productos transgénicos.

1. Aparte del principio de composable parts, enlistar los otros dos principios base de la Biología Sintética y argumentar si se cumplen en el organismo en el que fue utilizado elsistema.

Principios

Heterólogo:

Se identificaron sistemas, cada uno con alguna única función, en bacterias. Propiamente se usó Csy4 perteneciente a Pseudomonas aeruginosa, posteriormente se realizó la confirmación de la actividad de Csy4 en 3 especies de plantas, esto demostró la diversidad potencial de un sistema represor de dos componentes por medio de una proteína ajena a las plantas.

Ortogonal: Se demostró por medio de señales fluorescentes propias del uso de proteínas GFP y RFP, la nula acción de Csy4 en el desarrollo de la planta ni la expresión del gen transgénico.

ARTÍCULO 2[pic 7]

Anti-CRISPR-mediated control of gene editing and synthetic circuits in eukaryotic cells.

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Figura 2. Circuito presentado en el Artículo 2.

De la Figura 2, donde se muestra el sistema de CRISPRa (activador) y CRISPRi (inhibidor). Identificar y desglosar:

1. Todas las composable parts de ambos sistemas con una breve descripción de su función.

• Inductor:[pic 9]

CRISPR es el gen que activa o reprime la fusión de los dominios a dCas9. En este caso:

• CRISPRa es el gen de activación que fusiona el dominio VPR a dCas9.
• CRISPRi es el gen de inhibición que fusiona el dominio KRAB a dCas 9.

• Represor:[pic 10]

Anti-CRISPR protein (Acr) es un fragmento de proteínas bacteriológicas que inactivan a ciertos sistemas de CRISPR, inhibiendo la unión de un pequeño fragmento de proteínas Cas al DNA.

En el ensayo, al inhibir a CRISPRa con AcrIIA4 se demostró que hay un efecto negativo en la regulación del gen CRISPR.

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