¿Qué función realizan las ribonucleasa P y D?

¿Qué función realizan las ribonucleasa P y D?

Los tRNA citosolicos maduros, con una longitud promedio de 75-80 nucleótidos, se producen, a partir de precursores más grandes (pre-tRNA) sintetizados por la RNA polimerasa III en nucleoplasma. Los tRNA maduros también contienen numerosas bases modificadas que no están presentes en los transcriptos primarios de tRNA. La eliminación y la modificación de bases tienen lugar durante el procesamiento de todos los pre-tRNA; algunos pre-tRNA también son cortados y empalmados durante el procesamiento. Una secuencia 5´ de longitud variable que está ausente en los tRNA maduros está presente en todos los pre-tRNA. Estos nucleotidos 5´ extra son eliminados por una ribonucleasa P(RNasa P), una endonucleasa ribonucleoproteica. Los estudios con la RNasa P de E. coli indican que con altas concentraciones de mg+2, el componente de RNA solo puede reconocer y cortar los pre-tRNA de E. coli. El polipeptido de la RNasa P incrementa la velocidad de corte por el RNA y permite que continúe a concentraciones fisiológicas de mg+2. En los eucariotas funciona una RNasa P comparable.

El procesamiento del tRNA comienza con el corte por la ribonucleasa E o F, que forma un nuevo extremo 3´ inmediatamente corriente arriba de una de las horquillas. La ribonucleasa D, que es una exonucleasa, recorta siete nucleótidos de este nuevo extremo 3´ y hace una pausa mientras la ribonucleasa P efectuá un corte en el inicio de la hoja de trébol, lo que crea el extremo 5´ del tRNA maduro. Después, la ribonucleasa D elimina dos nucleótidos más, lo que forma el extremo 3´de la molécula madura. Todos los tRNA maduros deben terminar con trinucleotido 5´-CCA-3´. En el tRNATyr, el CCA terminal está presente en el pre-tRNA y no es eliminado por la ribonucleasa D, pero algunos otros pre-tRNA carecen de esta secuencia o esta eliminada por las ribonucleasas de procesamiento.

¿Qué factores de transcripción interaccionan con los promotores eucariotas y que función tienen?

RNA-polimerasa I

Los promotores que reconocen a la RNA-polimerasa I dirigen la transcripción de la mayoría de los genes ribosomales; por lo general, no contienen caja TATA. A su vez, los promotores ribosomales humanos se componen de un elemento central que traslapa el sitio de inicio de la tanscripcion y de un elemento de control “rio arriba” del inicio, localizado a – 100 pares de bases del sitio de inicio y fomenta los niveles de transcripción de 10 a 100 veces. La transcripción de estos genes ribosomales requiere, además de la RNA-polimerasa I, de la acción concertada de dos factores peptídicos: el factor UBF y el factor selectivo1 o SL1, el cual incluye a la proteína TBP. UBF se une de manera específica al elemento central, pero también al elemento UCE de los promotores. Por su parte, SL1 se une de manera cooperativa con el UBF. Lo cual ha dado pie a proponer que UBF se une primero al DNA, lo que provoca o induce el reclutamiento de SL1: estas interacciones incrementan considerablemente la formación del complejo de iniciación y por lo tanto, la acción de la RNA-polimerasa I. en humano el factor SL1esta constituido por la asociación entre TBP y un grupo de TAF de 48, 63 y KDa que son factores accesorios que forman parte del complejo de iniciación. Al parecer, las TAF son esenciales para las funciones del factor SL1, ya que estas funciones no pueden ser remplazadas por la TBP sola. Aquí se sugiere que la asociación SL1-TAF es importante para reclutar a la TBP en promotores para la RNA-polimerasa I, a través de interacciones proteína-proteína con el UBF y con el mismo DNA. Se propone que las interacciones proteína-proteína con el UBF pueden inducir cambios conformacionales en el complejo SL1, favoreciendo l acción de TBP o alguna de la TAF, para así unirse al DNA.

RNA-polimerasa II

La enzima RNA-polimerasa II transcribe la mayoría de los genes que codifican para proteínas celulares, al igual que algunos genes denominados RNA nucleares pequeños. Estos últimos son pequeños RNA que conforman el complejo de procesamiento necesario para madurar un pre-mRNA a mRNA maduro que serán transportados posteriormente del núcleo al citoplasma.

En la actualidad se conocen, al menos, 70 diferentes proteínas que en forma de subunidades funcionan de manera concertada para regular la transcripción por parte de la RNA-polimerasa II. Al parecer, muchas de estas proteínas, conocidas como factores de transcripción, interactúan entre ellas de manera específica para favorecer la actividad transcrpicional de un gen.

Por medio de experimento se han logrado identificar los factores de transcripción para la RNA-polimerasa II, los TFII A, B y D. de estas la fracción D es una de las más importantes, dado que tiene la capacidad de unirse a la secuencia TATA, secuencia que se encuentra presente en la gran mayoría de los promotores transcritos por la RNA polimerasa II. La transcripción comienza cuando la secuencia TATA es reconocida por la TBP, que es uno de los componentes del TFIID. La acción reguladora del complejo TFIID depende de la acción coordinada de otros factores de transcripción, conocidos como TAFs. La actividad de las TAFs permite de una manera muy organizada la función de otros seis complejos y, de esta manera, se forma el complejo de iniciación que a su vez permite reclutar a la RNA-polimerasa II e iniciar la transcripción.

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