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BÚSQUEDA DE SECUENCIAS DE GENES NUCLEARES


Enviado por   •  30 de Septiembre de 2022  •  Biografía  •  590 Palabras (3 Páginas)  •  91 Visitas

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 BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA[pic 1]

Semana 3

TALLER 3: BÚSQUEDA DE SECUENCIAS DE GENES NUCLEARES

Integrantes:

Realice la búsqueda de la información solicitada utilizando NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/) y Ensembl (https://www.ensembl.org/index.html)

  1. Ejemplo: INS (insulin) en caninos

NCBI

Especie de interés

Nombre científico de la especie

Taxonomy ID de la especie

Número de cromosomas de la especie

Información del gen

Gene ID

Nombre del Gen

Símbolo oficial

¿En qué cromosoma se encuentra?

N° exones

Tamaño del gen

Secuencia de referencia (RefSeq) del ARNm

¿En qué hebra se encuentra el gen dentro del cromosoma?

Pegar gráfico del gen (Formato NCBI):

Pegar secuencia en formato fasta del ARNm del gen (Formato NCBI):

Ensembl

Código Ensembl

Número de exones

Número de exones codificantes

Tamaño de ARNm

Longitud de CDS

Tamaño de la proteína (aa)

Pegar gráfico del gen (Formato Ensemble):

Pegar la secuencia completa del gen en formato fasta (extraído de Ensembl, indicando UTR, seq. codificante e intrones) aquí (Ctrl + Click para dirigir al sitio)

Pegar secuencia FASTA del ARNm (del Ensembl):

  1. Ejercicio 1: GLRA1 (glycine receptor Alpha 1) en bovinos

Especie de interés

Nombre científico de la especie

Taxonomy ID de la especie

Número de cromosomas de la especie

Información del gen

Gene ID

Nombre del Gen

Símbolo oficial

¿En qué cromosoma se encuentra?

N° exones

Tamaño del gen

Secuencia de referencia (RefSeq) del ARNm

¿En qué hebra se encuentra el gen dentro del cromosoma?

Pegar gráfico del gen (Formato NCBI):

Pegar secuencia en formato fasta del ARNm del gen (Formato NCBI):

Ensembl

Código Ensembl

Número de exones

Número de exones codificantes

Tamaño de ARNm

Longitud de CDS

Tamaño de la proteína (aa)

Pegar gráfico del gen (Formato Ensemble):

Pegar la secuencia completa del gen en formato fasta (extraído de Ensembl, indicando UTR, seq. codificante e intrones) aquí (Ctrl + Click para dirigir al sitio)

Pegar secuencia FASTA del ARNm (del Ensembl):

  1. Ejercicio 2: CLCN1 (chloride voltaje-gated channel 1) en caninos

Especie de interés

Nombre científico de la especie

Taxonomy ID de la especie

N° cromosomas de la especie

Información del gen

Gene ID

Nombre del Gen

Símbolo oficial

¿En qué cromosoma se encuentra?

N° exones

Tamaño del gen

Secuencia de referencia (RefSeq) del ARNm

¿En qué hebra se encuentra el gen dentro del cromosoma?

Pegar gráfico del gen (Formato NCBI):

Pegar secuencia en formato fasta del ARNm (Formato NCBI) del gen:

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