Colo Colo

Para el segundo semestre del año 2006, Udinese Calcio estima que Alexis necesita más experiencia como para jugar en la Serie A de Italia. Es así que se va en calidad de préstamo a Colo-Colo, que se hizo de sus servicios para el Torneo de Clausura y la Copa Sudamericana 2006.18

Con los albos Sánchez debutó oficialmente el 23 de julio del 2006 en un empate entre Colo-Colo y Antofagasta.19 Anotó su primer gol en el Torneo de Clausura 2006 29 de octubre del 2006 en el superclásico del fútbol chileno frente a la Universidad de Chile, a la cual vencieron 4-2.20 Al partido siguiente Sánchez anotó un doblete frente a Deportes Antofagasta, encuentro en que su equipo empató a cuatro.16 Finalmente Colo-Colo clasificó a los play-offs, enfrentándose en cuartos de final a Deportes Puerto Montt, al cual derrota por un global de cinco a cero, anotando Sánchez el último gol del cacique en el partido de vuelta.16 En semifinales Colo-Colo vence a Cobreloa y en la final derrota a Audax Italiano ganando Colo-Colo su vigésimo quinto título.16 Además Sánchez jugó ese año la Copa Sudamericana 2006, en la que jugó 9 partidos. En el torneo anotó un gol en el partido de vuelta jugado en el estadio Monumental frente a Liga Deportiva Alajuelense, el cual ganaron siete a dos.21 Colo-Colo llegó a la final del torneo, en la que fue derrotado por Pachuca, quedándose con el subcampeonato.22

En el Apertura 2007 Sánchez jugó catorce partidos anotando solo en una ocasión, frente a Santiago Wanderers en la décimo quinta fecha del torneo.23 Como en el torneo pasado Colo-Colo se coronó campeón del torneo, estando un punto sobre Universidad Católica.24 También jugó la Copa Libertadores 2007 en la que disputó 7 encuentros en los anotó tres veces, destacándose en el partido de visita frente a Caracas de Venezuela en que anotó su primer hat-trick.25

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