El análisis filogenético del gen de la neuraminidasa de la pandemia de influenza A H1N1 virus

El análisis filogenético del gen de la neuraminidasa de la pandemia de influenza A H1N1 virus que circula en la región de América del Sur.

Abstracto

Caracterización molecular de los virus circulantes de la gripe A (IAV) en todas las regiones del mundo es esencial para detectar mutaciones potencialmente implicados en una mayor virulencia, resistencia anti-viral y escape inmune. Con el fin de profundizar en estos temas, se realizó un análisis filogenético del gen de la neuraminidasa (NA) de 146 pandémica H1N1 (H1N1pdm) influenza A cepas del virus aisladas en Argentina, Brasil, Chile, Paraguay, Perú y Uruguay 2009-2.013. Comparación de la cepa de la vacuna A / California / 7/2009 incluidos en la vacuna contra la gripe recomendada para el hemisferio sur desde 2010 hasta 2013 las temporadas de gripe y las cepas aisladas en América del Sur reveló varias sustituciones de aminoácidos. Cartografía de estas sustituciones reveló que la mayoría de ellos se encuentran en la superficie de la proteína y no interfieren con el sitio activo. 3,4% de las cepas matriculados en estos estudios lleva a la sustitución H275Y que confiere resistencia al oseltamivir. Las cepas aisladas en América del Sur difieren de la vacuna en dos predijo regiones epítopo de células B presentes en las posiciones 102-103 y 351-352 de la proteína NA. Por otra parte, la vacuna y las cepas aisladas en Paraguay difieren también en un epítopo presente en la posición 229. Estas diferencias entre las cepas aisladas en América del Sur y cepa de la vacuna sugieren que estos epítopos pueden no estar presentes en las cepas aisladas de la región. Un posible nuevo sitio de glicosilación ligada a N se observó en la proteína NA de una cepa H1N1pdm IAV aislado en Brasil. Los resultados de estos estudios revelaron varias diferencias genéticas y antigénicas en el NA de H1N1pdm IAV entre la vacuna y las cepas que circulan en América del Sur. Todos estos hallazgos contribuyen a nuestra comprensión del curso de la evolución genética y antigénica de las poblaciones H1N1pdm IAV que circulan en la región de América del Sur y, en consecuencia, contribuir al estudio y selección de futuro y vacunas más apropiadas y medicamentos antivirales.

Caracterización molecular de los virus gripales circulantes (IAV) en todas las regiones del mundo es esencial para detectar mutaciones potencialmente involucrados en una mayor virulencia, resistencia anti-virales y escape inmunológico. A fin de obtener información sobre estas cuestiones, un análisis filogenético de la neuraminidasa (NA) en el gen de 146 H1N1 pandémico (H1N1PDM) cepas aisladas del virus de la influenza en Argentina, Brasil, Chile, Paraguay, Perú y Uruguay desde 2009 hasta 2013 fue realizada.

Comparación de la vacuna para la cepa A/California/7/2009 incluido en la vacuna antigripal recomendada para el hemisferio sur desde 2010 hasta 2013 la gripe temporadas y cepas aisladas en América del Sur reveló varias sustituciones de aminoácidos. La asignación de estas sustituciones, reveló que la mayoría de ellos se encuentran en la superficie de la proteína y no interfieren con el sitio activo. El 3,4% de las cepas matriculados en estos estudios el H275Y SUSTITUCIÓN que confiere resistencia al oseltamivir. Las cepas aisladas en América del Sur difieren de vacuna en dos predijo epítopo de células B regiones presentes en las posiciones 102-103 y 351-352 de la proteína NA. Además, la vacuna y cepas aisladas en Paraguay difieren también en un epítopo presentes en la posición 229. Estas diferencias entre las cepas aisladas en América del Sur y la cepa vacunal sugiere que estos epítopos no pueden estar presentes en las cepas aisladas en esta región. Un potencial nuevo N-ligados glicosilación sitio fue observada en la proteína NA de una H1N1PDM IAV cepa aislada en Brasil. Los resultados de estos estudios revelaron varias diferencias antigénicas y genéticas en el na de H1N1PDM IAV entre la vacuna y las cepas circulantes en América del Sur. Todos estos hallazgos contribuyen a nuestra comprensión del curso de genética y evolución antigénica del virus H1N1PDM IAV poblaciones circulantes en la región de América del Sur y, en consecuencia, contribuir al estudio y la selección de los futuros y más vacunas apropiadas y drogas anti-virales

1. Introducción

Influenza virus A (IAV) es un miembro de la familia Orthomyx-oviridae y contiene ocho segmentos de un genoma de ARN monocatenario con polaridad negativa (Neumann et al., 2004). IAV hace 300.000-500.000 muertes en el mundo cada año, y en los años de pandemia, este número puede aumentar a 1 millón (en 1957-1958) o comoInformática de alto como 50 millones de dólares, como se vio en 1918-1919 (Nguyen-Van-Tamand Hampson, 2003 ). IAV exhibe una evolución y dinámica molecular-com plejo rápidos patrones debido a su amplia gama de huéspedes, las altas tasas de sustituciones y la replicación rápida (Holmes, 2010) .Hemagglutinin (HA) y la neuraminidasa (NA) son los dos glicoproteínas ENVE-lope que son responsables para la fijación de los viriones a los receptores de acogida, la determinación de la patogenicidad, y la liberación de partículas virales recién producidos (Li et al., 2011). Las sustituciones de aminoácidos en estas glicoproteínas puede modificar la replicación del virus y el impacto sobre la posible propagación en la población humana (Pizzorno et al, 2012;. Abed et al., 2006). La AN también está jugando un papel importante como un objetivo de las llamadas individuales de las drogas anti-influenza disponibles, por ejemplo, Inhibidores de NA.La primera pandemia de gripe de este siglo fue declarado en abril de 2009, con la aparición de una nueva cepa H1N1 IAV (H1N1pdm) en México y los EE.UU. (CDC, 2009; OMS, 2009a, b, c) .Este virus se propagó rápidamente a la región de América del Sur, donde se detectó por primera vez en mayo de 2009 (Baker et al., 2009) Esto fue en la temporada típica de invierno para la transmisión de la gripe para los países de las regiones templadas del hemisferio sur, donde se observó una epidemia llena de H1N1pdm IAV y la cepa pandémica se convirtió en el virus de la influenza predominante en circulación, en sustitución de las cepas estacionales en muchos países (OMS, 2009b ). En virtud de la permanente evolución del H1N1pdm cepas dentro de la región de América del Sur es esencial para el estudio de la diversificación global y la resistencia antiviral de H1N1PDM IAV cepas circulantes en esta región del mundo, así como la determinación de la genética y la relación antigénica entre buques Sudamericano de H1N1PDM IAV cepas y cepas vacunales incluidos en la vacuna antigripal recomendada para el Hemisferio Sur.. Con el fin de estudiar la variabilidad genética y antigénica de este linaje H1N1 en la región de América del Sur, se realizó un análisis filogenético del gen NA de 146 cepas H1N1pdm IAV aislados en esta región 2009-2.013,2 El virus de la influenza (IAV) es un miembro de la familia Orthomyxoviridae y contiene ocho segmentos de ARN de un solo hilo genoma con polaridad negativa (Neumann et al., 2004). IAV Causas 300.000-500.000 muertes en todo el mundo cada año, y en años de pandemia, este número puede aumentar a 1 millones de euros (en 1957-1958) o tan alto como 50 millones de dólares, como se ha visto en 1918-1919 (Nguyen-Van-tam y Hampson, 2003). IAV exhibe una evolución rápida y complejos patrones de dinámica molecular debido a su amplio rango de hospederos , alta tasas de sustituciones y replicación rápida (Holmes, 2010).la hemaglutinina (HA) y neuraminidasa (NA) son los dos sobres de glicoproteínas que son responsables de la fijación de los viriones al host receptores, determinar la patogenicidad producidos recientemente, y la liberación de partículas virales (Li et al., 2011). Sustituciones de aminoácidos en estas glicoproteínas pueden modificar la replicación del virus y el impacto sobreel potencial de propagación en la población humana (Pizzorno et al., 2012;Abed et al., 2006). La NA también está desempeñando un papel importante como atarget de la única disponible de las llamadas drogas anti-influenza, p.ej. inhibidores de NA. La primera pandemia de gripe de este siglo fue declarada en abril de 2009, con la aparición de un nuevo virus H1N1, cepa IAV(H1N1PDM) en México y los EE.UU. (CDC, 2009; OMS, 2009a,b,c).Este virus propagarse rápidamente a la región de América del Sur, donde fue detectado por primera vez en mayo de 2009 (Baker et al., 2009). Esto fue en la temporada de invierno típico de transmisión de influenza para los países de las regiones templadas del hemisferio sur, donde toda una epidemia de H1N1PDM IAV se observó y se convirtió en la cepa pandémica del virus influenza circulantes predominantes, la sustitución de las cepas estacionales en muchos países (OMS, 2009b). En pie la evolución de cepas H1N1pdm dentro de la región de América del Sur es esencial para el estudio de la diversificación global y la resistencia antiviral de cepas H1N1pdm IAV que circulan en esta región del mundo, así como la determinación de las naves de relaciones genéticas y antigénicas entre Suramericanos cepas H1N1pdm IAV y cepas de vacunas incluidas en la vacuna contra la gripe recomendada para el hemisferio sur. A fin de estudiar la variabilidad antigénica y genética de este linaje de H1N1 en la región de América del Sur, se realizó un análisis filogenético de las Na gen de 146 H1N1PDM IAV cepas aisladas en esta región desde 2009 a 2013

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