Probabilidades De Que La Suma De Dos Cartas Sea 19

Luisa López

Constanza Acevedo

Taller de E. coli

1. Como se estudia la regulación de la transcripción de los sistemas metabólicos de E coli

El estudio sobre la regulación de la transcripción de los sistemas metabólicos del E. coli, se realiza en una escala genómica.

Se ha podido establecer como el sistema regulador de la transcripción controla el metabolismo de moléculas pequeñas en E. coli. Para ello se investiga la regulación de los distintos tipos de vías metabólicas en una escala global, y también se introduce una jerarquía funcional de TFS.A continuación, se examinan los patrones normativos a escala local, mediante la evaluación de cómo está la expresión génica mediada por reacciones metabólicas circundantes. Por último, se estudia la evolución de las rutas metabólicas y se evalúa si existe una relación entre la regulación coordinada y la conservación de las enzimas. De este modo, se establecen reglas del sistema de regulación transcripcional que son de aplicación general a los sistemas metabólicos bacterianos

2. En los resultados, como los investigadores pudieron dar la regulación global de las enzimas metabólicas

A través del estudio de la evolución de las rutas metabólicas y posterior análisis de la existencia de una relación entre la regulación coordinada y la conservación de las enzimas es posible establecer reglas generales aplicables a los sistemas metabólicos bacterianos.

El presente estudio utiliza cinco conjuntos de datos diferentes:

Una red metabólica que comprende 788 reacciones asignados a781 genes de enzimas y 628 pequeñas moléculas de la EcoCycbase de datos, una red de regulación transcripcional regulan la participación de 111 TFS 388 genes de enzimas (49,7% de todas las enzimas) a través de 913 interacciones de reglamentación, provenientes de RegulonDB, 43 interacciones de unión entre 40 TFS y 39 pequeñas moléculas de EcoCyc representan regulación post-traduccionalde la actividad TF;Affymetrixmicroarrays de datos que cubren 221 hibridaciones mRNA a través de diversas condiciones celulares de la base de datos M3D, y las secuencias de proteínas de E. coli K12 MG1655 y otros 380 organismos procariotas con genomas secuenciados completamente obtenidos a partir de la base de datos KEGG Los primeros cuatro conjuntos de datos contienen información sólo para E. coli K12.

3. Explique el diagrama n 1, expresión de las vías catabólicas, y anabólicas en e coli.

El Diagrama 1 explica los objetivos generales y específicos de la regulación de TFS y la relación entre estos y las células diana. Para este efecto los círculos rojos representan los TFS generales, los círculos azuleslos TSF específicos y los círculos negros los genes de enzimas diana. Las líneas muestran las interacciones reguladoras entre células diana, TSF generales y TSF específicos.

TFS generales muestran los niveles de expresión de ARNm superiores TFS específicas cuando se examinan los datos de AffymetrixGeneChips (P Mann-Whitney = 5,6* 10-5). Esto refleja el hecho de que las células requieren grandes cantidades absolutas de TFS generales ya que tienen que unir muchos más objetivos .

De acuerdo con observaciones anteriores, los genes de TFS específicos tienden a ser codificados mucho más cerca de sus sitios de unión a la diana, en contraste con TFS generales (P Mann-Whitney<2,2* 10-16). En procariotas, la transcripción y la traducción están estrechamente acoplados, asegurando que el producto proteico se produzca generalmente cerca del gen que codifica en el cromosoma. Como los TFS específicos se expresan en pequeñas cantidades y

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