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Su objetivo es obtener un gran número de copias de DNA partiendo de un mínimo.


Enviado por   •  9 de Abril de 2018  •  Resumen  •  559 Palabras (3 Páginas)  •  122 Visitas

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Técnica

 Características

Ventajas

Desventajas

Aplicaciones

PCR Punto Final

Su objetivo es obtener un gran número de copias de DNA partiendo de un mínimo.

Necesitamos:

  • Polimerasa
  • Primers (Fw y Rv)
  • Agua
  • Buffer
  • dNTP´s
  • DNA molde

Es más económica en comparación a otras técnicas de PCR.

La amplificación del gen de interés puede ser poco especifica

- Detección de mutaciones

- Identificación de cadáveres

- Pruebas de paternidad

- Investigación científica

- Diagnóstico de enfermedades genéticas e infecciosas

PCR Anidada (nested)

Su objetivo es incrementar la sensibilidad de detección y especificidad, y se llevan a cabo dos rondas de amplificación.

Se utilizan dos pares de primers (externos e internos)

Más especifica que PCR punto final

Aumenta la posibilidad de que la reacción se contamine.

No es posible cuantificar la muestra

- Diagnóstico de enfermedades genéticas o infecciosas

- Detección de mutaciones con mayor especificidad

- Investigación cientifica

PCR Múltiple

Se utiliza cuando se desea amplificar más de dos fragmentos en la misma muestra

- Se utilizan más de dos pares de primers (cada par, para cada fragmento en específico que se desea amplificar)

- Mayor eficiencia

- Indicación de la calidad y cantidad de la plantilla

- No compromete la utilidad del experimento

- Ahorro de tiempo y esfuerzo

- Difícil optimización.

- Aumenta el costo

- Hibridación cruzada

- Unión de primers a fragmentos incorrectos

- Identificación de mutaciones

- Identificación de patógenos

- Detección de RNA

- Estudios Forenses

PCR Hot Start

Se utiliza cuando se necesita que sólo se amplifique el fragmento de interés (amplificación específica).

La reacción comienza cuando la temperatura es de 95°C , por el uso de anticuerpos, antipolimerasa, separación de los reactivos con cera o agregando la polimerasa después del periodo de calentamieno.

- Evita que los cebadores se unan a secuencias de plantillas no correspondientes.

- No se unen los primers entre si

- Aumenta la sensibilidad y rendimiento de la amplificación del fragmento de interés.

- El costo aumenta en comparación con el uso de PCR punto final.

- Se puede contaminar la reacción al agregar los primers, después del periodo de calentamiento.

- Identificación de patógenos

- Detección de mutaciones

- Identificación de cadáveres

- Investigación científica

PCR Touchdown

Esta técnica se utiliza cuando no es bien conocida la secuencia o el primer.

Inicia 5 o 10ºC por arriba de la temperatura de fusión  y termina con 2 o 5ºC por debajo de la temperatura de fusiòn

Útil en plantillas difíciles de amplificar.

-Útil cuando la complementariedad entre los cebadores es incierto.

- Aumenta la sensibilidad, especificidad y rendimiento.

- No se puede evaluar de manera cuantitativa la concentración del objetivo

- Identificación de patógenos

PCR Asìmetrica

Se utiliza para amplificar en mayor proporción una de las cadenas de DNA molde, por lo que se tiene que agregar en mayor proporción uno de los primers (Fw o Rv). La cadena resultante se puede utilizar para ser secuenciada o como sondas para hibridaciones.

- Útil para la secuenciación de cadenas sencillas

-No podemos cuantificar la muestra

  • Secuanciaciòn
  • Para hacer sondas de hibridaciòn

PCR In Situ

Se amplifican fragmentos de DNA en tejidos o células,

Se realizan en porta objetos.

-Útil cuando no contamos con DNA, pero si de células o tejidos.

-Pueden detectarse cantidades pequeñas del genoma

-Alta sensibilidad

-Se requieren de equipos costosos

-Se debe destruir las células o el tejido a evaluarse

-Muy útil para la detección de agentes infecciosos en diferentes tejidos o células.

PCR de Colonia

Se realiza la amplificación de algún fragmento de interes a partir de una colonia, no es necesaria la extracción del DNA, se hace uso de un vector recombinante

  • Disminuye el tiempo de amplificación

-No se puede cuantificar el material obtenido.

-Útil para la identificación de clonas recombinantes

PCR Long

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