TALLER DE BIOQUIMICA . AMINOACIDOS Y PROTEINAS

UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA-SEDE PALMIRA

TALLER DE BIOQUIMICA                                                          

TEMA: AMINOACIDOS Y PROTEINAS                                                      

1. Clasificar como polar o no polar:

1. H2N(CH2)3CH(NH2)COOH
2. CH3(CH2)5CH(NH2)COOH

1. [pic 1]
2. CH3CH(NH2)CH2CH(NH2)COOH
3. CH3CH=CH-CH2-CH2-CH(NH2)COOH
4. [pic 2]

1. Dibuje las estructuras y muestre las disociaciones de los siguientes aminoácidos con los cambios de pH: Treonina, Valina, lisina, tirosina, acido aspártico. Qué carga neta tendría cada especie? Calcular los puntos isoeléctricos de los aminoácidos.

1. Identifique dos aminoácidos que contienen más de un carbono quiral.        

1. Hallar el punto isoeléctrico (pI) de los siguientes aminoácidos: (a) Glicina (pKa1= 2,34 pKa2= 9,6); (b) Serina (pKa1= 2,1 pKa2=9,2); (c) A. Glutámico (pKa1= 2,1 pKa2= 4,1 pKa3= 9,5); (d) Lisina (pKa1= 2,2 pKa2= 9,7 pKa3= 10,8), (e) Tirosina (pKa1= 2,2 pKa2= 9,1 pKa3= 10.1) y Cisteína  (pKa1= 1.96 pKa2= 8.18 pKa3= 10.28) .

1. Cuáles de los siguientes aminoácidos son α–aminoácidos?

1. Ornitina H2N-(CH2)3-CH (NH2)COOH
2. H2N-(CH2)2-COOH
3. H2N-(CH2)3-COOH
4. [pic 3]hidroxiprolina

1. Qué aminoácidos pueden tener una capacidad buffer efectiva a: a) pH= 4, b) pH= 6, c) pH=7, d) pH=9.

1. Usando los valores de pK para el acido aspártico, determine la carga del aminoácido a pH 1, 3.9 y 6.8.
2. Para los aminoácidos acido glutámico y lisina, esboce la curva de titulación y dibuje las estructuras de las especies iónicas predominantes en cada punto de la titulación.

1. A qué valores de pH seria el glutamato un buen buffer?
2. Por qué la fenilalanina es pobremente soluble en agua, mientras que la serina es bastante soluble?
3. Identifique los aminoácidos cuya cadena lateral cumple estas descripciones:

1. Contiene un grupo amino
2. Contiene un anillo heterocíclico
3. Contiene un anillo bencénico no sustituido
4. Contiene un grupo carboxilo
5. Contiene un grupo sulfhidrilo

1. Predecir el movimiento relativo de Val, His y Glu en electroforesis en papel llevada a cabo a pH 2, 6 y 11.

1. Una mezcla de Met, Lys, Asp y Thr se sometió a electroforesis a pH 5,5. ¿Hacia qué polo (+,-,o) se mueve cada uno de los aminoácidos?

1. Una solución de His, Arg, Asp y Ser se sometió a electroforesis a pH 5,5. ¿Hacia qué polo  (+,-,o) se mueve cada uno de los aminoácidos?

1. Determine el punto isoeléctrico de los siguientes péptidos:

1. Thr-Arg-His-Tyr-Glu
2. Met-Glu-Phe-Asp-Leu-Val-His-Lys
3. H3N+-Lys-Tyr-Asp-Glu-COOH
4. H3N+-Glu-Asp-His-Gly-Asp-Glu-Cys-COOH
5. H3N+-Asp-Arg-Arg-Gly-Arg-Asp-Arg-COOH
6. Lys-Ser-Asp-Ala, en qué dirección se moverá el péptido cuando se coloque en un campo eléctrico a pH 4 y 9?

1. Un péptido tiene la secuencia: Glu-His-Trp-Ser-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly

1. Cuál es la carga neta de la molécula a pH 3, 8 y 11?
2. Estime el punto isoeléctrico para este péptido.

1. Un péptido tiene la secuencia: Glu-Phe-Lys-His-Ile-Arg-Val

1. Cuál es la carga neta de la molécula a pH 1, 7 y 11.5?
2. Estime el punto isoeléctrico para este péptido.

1. Escriba formulas estructurales para:

1. Glicilalanina
2. Fenilalanilglicilalanina
3. Cys-Val-Gly
4. Cuál es la secuencia de aminoácidos para este péptido? Use abreviaturas para los aminoácidos.

[pic 4]

1. Por qué una secuencia de residuos lisilo en una cadena polipeptídica desestabilizaría una conformación α–helicoidal?

1. Las siguientes parejas de aminoácidos mantienen la estructura terciaria de un péptido. En cada caso, identifique el tipo de interacción que existe entre ellos:

1. Acido aspártico y lisina
2. Fenilalanina y alanina
3. Serina y lisina
4. Dos cisteínas

1. Dados los siguientes péptidos:

1. Gly-Ala-Asp-Pro-Lys-Met-Cys-Phe-Lys-Arg-Glu-Asp-Ser, cuál sería su carga neta a pH 1 y 7?
2. Cuantos residuos aminoácidos ramificados, azufrados e hidroxilados tiene?
3. Cuantos grupos R apolares y polares sin carga tiene el péptido a pH fisiológico?
4. Glu-Phe-Lys-His-Ile-Arg-Val, cuál sería su carga a pH 1, 7 y 11,5?

1. Clasifique estas proteínas como globulares o fibrosas:

1. Hemoglobina        b. keratina        c. mioglobina           d. miosina

1. Para cada uno de los siguientes aminoácidos, diga si es más probable que estén afuera o adentro de una proteína globular:

1. Fenilalanina        c. Serina        e. Leucina
2. Acido aspártico        d. Lisina        f. Acido glutámico

1. Cuáles son los tipos de enlaces responsables de la estructura de una proteína? Complete.

1. En la siguiente tabla identifique proteínas que cumplan las funciones indicadas:

1. Indique al frente de cada proceso si se refiere a una desnaturalización o a una hidrólisis.

1. Cambios en la superficie (cuando se baten los huevos): _________________________
2. Ablandar la carne usando enzimas (papaína: _________________________________
3. Modificación de la concentración salina: ____________________________________
4. Elaboración del queso usando la enzima renina: ______________________________
5. Digestión de las proteínas en el estómago: __________________________________
6. Modificación del pH (elaboración de yogurt): _______________________
7. Calor (cocción de los alimentos): _____________________

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